Ботанический сад располагается в непосредственной близости от Новосибирского Академгородка и занимает территорию площадью 850 га. На ней располагаются главный лабораторный корпус, технический блок, оранжереи, теплицы, экспериментально-производственный корпус, клубнехранилище, объекты технической базы, складские помещения.
По территории Ботсада протекает речка Зырянка, на которой расположен пруд.
За долгие годы кропотливого труда здесь создана невероятная по своему разнообразию коллекция. Например, в оранжерейной части сада вы найдете более 3000 видов растений — ярких представителей тропиков и субтропиков, в дендрарии и лесопарковой зоне — около 400 видов, в экспозиции «Сад непрерывного цветения» — порядка 520 разновидностей флоры. В саду можно увидеть богатейшую подборку лишайников и грибов. Особое внимание сотрудники Ботанического сада уделяют сохранению редких и исчезающих видов. Их в парке более сотни.
Одно из самых ярких впечатлений оставляет посещение сада зимой. Открывается дверь оранжереи, и из суровых сибирских морозов в один миг вы попадаете в тропический рай! Теплый влажный воздух тропиков, захватывающая красота растений, необыкновенные ароматы и цвета переполняют посетителей восторгом. Растения в оранжерее очень вдумчиво подобраны в композиции и создают друг для друга прекрасную декорацию. В каждом цветке заметен бережный уход за ним.